样品要求 样品类型 细胞、组织或RNA,其他样本类型请电询。 样品量 a)细胞:≥2×107 b)组织:500mg - 1g c) RNA:30μg - 300μg d) 超微量满足500ng - 30μg 样品运输与保存 样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。云序优势 一站式服务: 客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。RNA甲基化普遍存在于拟南芥各个发育期。江苏mRNA甲基化
目前还没有一种完善的方法可以在单碱基分辨率下对每个转录本进行m6A的鉴定,这对评估m6A丰度是必要的。作者开发了一种新的方法,称为Nanom6A,用于在单碱基分辨率下鉴定和定量m6A修饰,使用基于XGBoost模型的纳米孔直接RNA测序。并使用MeRIP-Seq和m6A-REF-seq验证了此方法,证实了较高的准确性。利用这种方法,作者进行了毛果杨茎分化木质部中转录组范围的m6A修饰定量分析,揭示了不同的可变聚腺苷酸化(APA)量会导致不同的m6A修饰比例。河北甲基化芯片m6A在细胞加速mRNA代谢和翻译,以及在细胞分化、胚胎发育和压力应答等过程中起重要作用。
植物m6A表观转录组修饰的生物学功能尚不完全清楚。CPSF30-L是聚腺苷酸化因子CPSF30的主要亚型,由CPSF30-S和一个m6A结合的YTH结构域组成。CPSF30-L的生物学作用及其在选择性聚腺苷酸化中结合m6A功能的分子机制尚不清楚。在这里,作者揭示了CPSF30-L是拟南芥m6A的“reader”,其m6A结合功能是花卉的转型和脱落酸(ABA)响应所必需的。此外,CPSF30-L的m6A结合活性增强了液体样核体的形成,其中CPSF30-L主要识别m6A修饰的远上游元件,调控聚腺苷酸化位点的选择。
云序优势 一站式服务 客户只需提供组织、细胞、体液样品或RNA,云序生物为您完成从ac4C RNA富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。 抗体富集效率高 acRIP-seq的富集效率是决定数据质量的关键,云序生物acRIP-seq实验采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程,具有极高的效率和特异性。 分子全覆盖 可检测mRNA、circRNA、LncRNA、pri-miRNA、rRNA、tRNA等多类RNA分子ac4C乙酰化位点。 严格的质控 云序生物对acRIP-seq实验每一步骤均设有关键质控,全程监控实验质量,保证客户得到数据。 专业的生物信息学分析 云序生物拥有专业的生物信息分析团队,帮助客户进行实验数据的挖掘。 RNA乙酰化测序与转录组联合应用 可整合RNA乙酰化数据和转录组数据进行生物信息学关联分析,揭示RNA乙酰化对基因表达调控的影响,深入挖掘RNA乙酰化的功能。 ctDNA 的 5mC 甲基化修饰研究仍然是一个未被充分探索的领域。
云序生物提供两种m7GRNA甲基化测序服务:(1)m7GRNA甲基化单碱基测序,可对m7G修饰进行高通量检测和单碱基定位;(2)MeRIP测序,可通过m7G特异性抗体,抓取有甲基化修饰的片段进行测序,对m7G修饰进行高通量测序和peak峰定位。此外,云序生物针对m7GRNA甲基化开发了多款产品,可实现对mRNA、LncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA等多类RNA分子的m7G甲基化修饰水平的整体检测。云序优势一站式服务:客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。包括:mRNA 5’帽子结构、mRNA内部、pri-miRNA、转运RNA(tRNA)和核糖体RNA(rRNA)。上海甲基化利器
种种研究迹象表明m6A 存在于很多物种中,占到了 RNA甲基化修饰的80%。江苏mRNA甲基化
云序优势一站式服务:客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。样本要求样品类型:细胞、新鲜组织或RNA样品。其它类型样品请详询。样品量:a)细胞:2×107b)组织:100mg-1gc)RNA:30-300μg(OD260/280:1.6-2.3;RNA无明显降解28S:18S>1.5或RIN>7)样品运输与保存样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。江苏mRNA甲基化
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